MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
2	NC_010683	GTC	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
3	NC_010683	GCCT	2	8	139	146	0 %	25 %	25 %	50 %	187930823
4	NC_010683	GCAG	2	8	205	212	25 %	0 %	50 %	25 %	187930823
5	NC_010683	CGT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
6	NC_010683	CG	3	6	348	353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930824
7	NC_010683	CAG	2	6	366	371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930824
8	NC_010683	TCG	2	6	382	387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
9	NC_010683	GGC	2	6	404	409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930824
10	NC_010683	TGG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930824
11	NC_010683	GCG	2	6	683	688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930825
12	NC_010683	CAT	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930825
13	NC_010683	TTC	2	6	713	718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930825
14	NC_010683	TAC	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930826
15	NC_010683	CGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930826
16	NC_010683	GCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930826
17	NC_010683	GCCA	2	8	1202	1209	25 %	0 %	25 %	50 %	187930826
18	NC_010683	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	187930826
19	NC_010683	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930826
20	NC_010683	TGA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
21	NC_010683	CGC	2	6	1388	1393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
22	NC_010683	GC	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
23	NC_010683	GGC	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
24	NC_010683	GTC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
25	NC_010683	TGCG	2	8	1489	1496	0 %	25 %	50 %	25 %	187930827
26	NC_010683	CG	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
27	NC_010683	GCG	2	6	1619	1624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
28	NC_010683	GAA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930827
29	NC_010683	ACG	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930827
30	NC_010683	TGC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
31	NC_010683	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
32	NC_010683	TGA	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
33	NC_010683	TGG	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
34	NC_010683	CGGCC	2	10	1793	1802	0 %	0 %	40 %	60 %	187930827
35	NC_010683	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
36	NC_010683	TGCC	2	8	1885	1892	0 %	25 %	25 %	50 %	187930827
37	NC_010683	GCCG	2	8	1923	1930	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
38	NC_010683	CG	3	6	1929	1934	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
39	NC_010683	CGG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
40	NC_010683	GGT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
41	NC_010683	GC	3	6	2087	2092	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
42	NC_010683	GCT	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
43	NC_010683	CTG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
44	NC_010683	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
45	NC_010683	CGCA	2	8	2240	2247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930827
46	NC_010683	GGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
47	NC_010683	GGC	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
48	NC_010683	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
49	NC_010683	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
50	NC_010683	GCC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
51	NC_010683	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
52	NC_010683	CGC	2	6	2507	2512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
53	NC_010683	GCC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
54	NC_010683	CGG	2	6	2588	2593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
55	NC_010683	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
56	NC_010683	GCC	2	6	2662	2667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
57	NC_010683	TGG	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
58	NC_010683	GCT	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
59	NC_010683	GCC	2	6	2781	2786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
60	NC_010683	GCC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
61	NC_010683	CGC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
62	NC_010683	CCG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
63	NC_010683	CGAG	2	8	3436	3443	25 %	0 %	50 %	25 %	187930828
64	NC_010683	CGA	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
65	NC_010683	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
66	NC_010683	TTC	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
67	NC_010683	TTC	3	9	3594	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
68	NC_010683	TGC	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
69	NC_010683	TGC	3	9	3633	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
70	NC_010683	CACC	2	8	3649	3656	25 %	0 %	0 %	75 %	187930828
71	NC_010683	CAC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930828
72	NC_010683	GCG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930828
73	NC_010683	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
74	NC_010683	ATG	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930828
75	NC_010683	TC	3	6	4076	4081	0 %	50 %	0 %	50 %	187930829
76	NC_010683	CG	3	6	4095	4100	0 %	0 %	50 %	50 %	187930829
77	NC_010683	CGA	3	9	4112	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930829
78	NC_010683	TCA	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930829
79	NC_010683	GCC	2	6	4152	4157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930829
80	NC_010683	TTC	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930829
81	NC_010683	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930830
82	NC_010683	CCGT	2	8	4385	4392	0 %	25 %	25 %	50 %	187930830
83	NC_010683	GT	3	6	4428	4433	0 %	50 %	50 %	0 %	187930830
84	NC_010683	CCG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930830
85	NC_010683	GCG	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930830
86	NC_010683	GGA	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930830
87	NC_010683	CAAG	2	8	4612	4619	50 %	0 %	25 %	25 %	187930830
88	NC_010683	TCG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930830
89	NC_010683	GTTC	2	8	4781	4788	0 %	50 %	25 %	25 %	187930831
90	NC_010683	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
91	NC_010683	CAT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930831
92	NC_010683	ATG	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
93	NC_010683	CAG	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930831
94	NC_010683	CAC	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930831
95	NC_010683	GCAAA	2	10	5054	5063	60 %	0 %	20 %	20 %	187930831
96	NC_010683	GTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
97	NC_010683	TCTA	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	187930832
98	NC_010683	CAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930832
99	NC_010683	CAA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930832
100	NC_010683	GCC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930832
101	NC_010683	T	6	6	5410	5415	0 %	100 %	0 %	0 %	187930832
102	NC_010683	CTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930833
103	NC_010683	GCC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930833
104	NC_010683	GTT	2	6	5550	5555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930833
105	NC_010683	ACC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
106	NC_010683	TCC	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930833
107	NC_010683	TCG	3	9	5599	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930833
108	NC_010683	CCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
109	NC_010683	GGC	2	6	5733	5738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930833
110	NC_010683	AGCT	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	187930834
111	NC_010683	GCC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930834
112	NC_010683	TGG	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930834
113	NC_010683	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930835
114	NC_010683	ACTCA	2	10	6159	6168	40 %	20 %	0 %	40 %	187930835
115	NC_010683	GAT	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930835
116	NC_010683	CG	4	8	6266	6273	0 %	0 %	50 %	50 %	187930835
117	NC_010683	TCG	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
118	NC_010683	CTGG	2	8	6402	6409	0 %	25 %	50 %	25 %	187930835
119	NC_010683	GCC	2	6	6474	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
120	NC_010683	CGC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
121	NC_010683	TCG	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
122	NC_010683	CGT	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
123	NC_010683	ACA	2	6	6640	6645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930835
124	NC_010683	TGG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930835
125	NC_010683	CTG	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
126	NC_010683	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
127	NC_010683	CGA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930836
128	NC_010683	GCACTT	2	12	7025	7036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930836
129	NC_010683	GCC	2	6	7042	7047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930836
130	NC_010683	TTC	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930836
131	NC_010683	CGT	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930836
132	NC_010683	GC	3	6	7130	7135	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
133	NC_010683	GCCG	2	8	7193	7200	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
134	NC_010683	CCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930836
135	NC_010683	ATCCGA	2	12	7461	7472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930836
136	NC_010683	GCG	2	6	7514	7519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930836
137	NC_010683	GCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
138	NC_010683	CA	3	6	8431	8436	50 %	0 %	0 %	50 %	187930837
139	NC_010683	GAAGG	2	10	8512	8521	40 %	0 %	60 %	0 %	187930837
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143	NC_010683	TGGG	2	8	8685	8692	0 %	25 %	75 %	0 %	187930837
144	NC_010683	CTGGT	2	10	8730	8739	0 %	40 %	40 %	20 %	187930837
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156	NC_010683	CCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930838
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250	NC_010683	CAGC	2	8	16240	16247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930844
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258	NC_010683	CCA	2	6	16402	16407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930844
259	NC_010683	CG	4	8	16462	16469	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
260	NC_010683	CAG	2	6	16491	16496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
261	NC_010683	CAG	2	6	16507	16512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
262	NC_010683	CAG	2	6	16516	16521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
263	NC_010683	TCG	2	6	16523	16528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930844
264	NC_010683	CG	3	6	16527	16532	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
265	NC_010683	CAG	2	6	16540	16545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
266	NC_010683	TTC	2	6	16567	16572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930844
267	NC_010683	CTG	2	6	16612	16617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930844
268	NC_010683	CG	4	8	16621	16628	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
269	NC_010683	TG	3	6	16652	16657	0 %	50 %	50 %	0 %	187930844
270	NC_010683	GGT	2	6	16675	16680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930844
271	NC_010683	CGA	2	6	16726	16731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
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273	NC_010683	GTG	2	6	16799	16804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930844
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275	NC_010683	GCA	2	6	16856	16861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930844
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277	NC_010683	CG	3	6	16890	16895	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
278	NC_010683	GGC	2	6	16897	16902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930844
279	NC_010683	GGC	3	9	16915	16923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930844
280	NC_010683	GTC	2	6	16930	16935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930844
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282	NC_010683	CAT	2	6	17487	17492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930845
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286	NC_010683	AGCGCT	2	12	17754	17765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930845
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288	NC_010683	GTT	2	6	17817	17822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930845
289	NC_010683	GAA	2	6	17883	17888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930845
290	NC_010683	GTT	2	6	17907	17912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930845
291	NC_010683	CTG	2	6	18004	18009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
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293	NC_010683	CTG	2	6	18089	18094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
294	NC_010683	CAAG	2	8	18103	18110	50 %	0 %	25 %	25 %	187930845
295	NC_010683	GAT	2	6	18159	18164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930845
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297	NC_010683	CTG	2	6	18265	18270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
298	NC_010683	AGCG	2	8	18291	18298	25 %	0 %	50 %	25 %	187930845
299	NC_010683	ATC	2	6	18343	18348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930845
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302	NC_010683	AG	3	6	18534	18539	50 %	0 %	50 %	0 %	187930845
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382	NC_010683	GCT	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930850
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385	NC_010683	ATCT	2	8	24017	24024	25 %	50 %	0 %	25 %	187930851
386	NC_010683	TAC	2	6	24057	24062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930851
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388	NC_010683	TCT	2	6	24238	24243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930851
389	NC_010683	CAC	2	6	24278	24283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930851
390	NC_010683	GCG	3	9	24543	24551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930852
391	NC_010683	CCAT	2	8	24552	24559	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
392	NC_010683	AAC	2	6	24645	24650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930852
393	NC_010683	CGA	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
394	NC_010683	TGC	2	6	24827	24832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930852
395	NC_010683	ACTC	2	8	24865	24872	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
396	NC_010683	CTC	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
397	NC_010683	CTC	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
398	NC_010683	ATCG	2	8	25024	25031	25 %	25 %	25 %	25 %	187930852
399	NC_010683	GAT	2	6	25134	25139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930852
400	NC_010683	CCT	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
401	NC_010683	GC	3	6	25168	25173	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
402	NC_010683	ACA	2	6	25216	25221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930852
403	NC_010683	CGA	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
404	NC_010683	AAAG	2	8	25347	25354	75 %	0 %	25 %	0 %	187930852
405	NC_010683	GCA	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
406	NC_010683	CAC	2	6	25385	25390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930852
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408	NC_010683	CGA	2	6	25501	25506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
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411	NC_010683	CGA	2	6	25761	25766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
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413	NC_010683	GCC	2	6	25847	25852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930852
414	NC_010683	GCC	2	6	25864	25869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930852
415	NC_010683	GTT	2	6	25899	25904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930852
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422	NC_010683	CG	3	6	26180	26185	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
423	NC_010683	ACA	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930853
424	NC_010683	CG	3	6	26517	26522	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
425	NC_010683	CTG	2	6	26527	26532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930853
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428	NC_010683	CGC	2	6	26679	26684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930853
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434	NC_010683	GTCG	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	187930853
435	NC_010683	CCATGG	2	12	27062	27073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930853
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443	NC_010683	TCGAC	2	10	27456	27465	20 %	20 %	20 %	40 %	187930854
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497	NC_010683	GATC	2	8	31095	31102	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
498	NC_010683	CGCC	2	8	31115	31122	0 %	0 %	25 %	75 %	187930857
499	NC_010683	GC	3	6	31128	31133	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
500	NC_010683	GCA	2	6	31142	31147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930857

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